中國(guó)科學(xué)院院士陳潤(rùn)生:大數(shù)據(jù)治病時(shí)代已來(lái)臨
陳潤(rùn)生 | 2016-06-08 16:15
【數(shù)據(jù)猿導(dǎo)讀】 近年來(lái),隨著互聯(lián)網(wǎng)與傳統(tǒng)醫(yī)療的融合,醫(yī)學(xué)界開始在研究大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上不斷探索發(fā)現(xiàn)新的生物學(xué)規(guī)律。如今,這些數(shù)據(jù)能為工業(yè)生產(chǎn)、醫(yī)療實(shí)踐提供哪些更好的服務(wù)呢?我們來(lái)看中國(guó)科學(xué)院院士陳潤(rùn)生是如何看待這些問(wèn)題

生物大數(shù)據(jù)最核心的部分是組學(xué)數(shù)據(jù),而組學(xué)數(shù)據(jù)中最基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)是基因組數(shù)據(jù)。有了近年的基因組研究才派生出蛋白質(zhì)組、代謝組、生物網(wǎng)絡(luò)。也正是因?yàn)榛蚪M的研究,才使得生物大數(shù)據(jù)實(shí)實(shí)在在地成為了大數(shù)據(jù)。近年來(lái),隨著互聯(lián)網(wǎng)與傳統(tǒng)醫(yī)療的融合,醫(yī)學(xué)界開始在研究大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上不斷探索發(fā)現(xiàn)新的生物學(xué)規(guī)律。如今,這些數(shù)據(jù)能為工業(yè)生產(chǎn)、醫(yī)療實(shí)踐提供哪些更好的服務(wù)呢?對(duì)此,記者近日專訪了中國(guó)科學(xué)院院士陳潤(rùn)生。
“我可以很肯定地回答,利用大數(shù)據(jù)治療疾病,這樣的時(shí)代已經(jīng)來(lái)臨……非編碼核酸為科研的創(chuàng)新提供了非常廣闊的空間,是生物大數(shù)據(jù)研究的重要源泉。”
陳潤(rùn)生
中國(guó)科學(xué)院院士,中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所非編碼核酸重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員。是中國(guó)最早從事理論生物學(xué)和生物信息學(xué)研究的科研人員之一,曾參加中國(guó)第一個(gè)完整基因組泉生熱袍菌B4基因組序列的組裝和基因標(biāo)識(shí),以及人類基因組1%和水稻基因組工作草圖的研究。
大數(shù)據(jù)治病時(shí)代已來(lái)臨 分析非編碼可抑制腫瘤發(fā)展
記者:利用大數(shù)據(jù)治療疾病離我們還遠(yuǎn)嗎?
陳潤(rùn)生:我可以很肯定地回答,利用大數(shù)據(jù)治療疾病,這樣的時(shí)代已經(jīng)來(lái)臨。
在人的遺傳碼3×109次方里面,編碼蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)基因只占3%,另外97%所蘊(yùn)含的重大規(guī)律迄今為止還沒(méi)有被發(fā)現(xiàn)。早在幾年前,《科學(xué)》在評(píng)價(jià)人類進(jìn)入21世紀(jì)科學(xué)進(jìn)展的時(shí)候,提出了自然科學(xué)領(lǐng)域的十大突破,第一個(gè)就是基因組當(dāng)中的暗物質(zhì)——非編碼核酸,這給實(shí)際應(yīng)用帶來(lái)無(wú)數(shù)創(chuàng)新的機(jī)會(huì)。
我們進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),這些轉(zhuǎn)錄出來(lái)的非編碼核酸具有非常重要的功能。比如,調(diào)控女性一條X染色體失活后,使得男性和女性伴隨X染色體轉(zhuǎn)錄的基因拷貝數(shù)保持一致的元件,會(huì)產(chǎn)生一個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼;通過(guò)這些編碼就可以分析引發(fā)疾病的原因,調(diào)控使癌變細(xì)胞凋亡,從而抑制腫瘤的進(jìn)展。
所以,非編碼核酸為科研的創(chuàng)新提供了非常廣闊的空間,是生物大數(shù)據(jù)研究的重要源泉。這類大數(shù)據(jù)的破解不僅可為基礎(chǔ)研究增添理論基礎(chǔ),也同時(shí)為疾病的診斷和治療,為全新的藥物設(shè)計(jì)和研發(fā),為動(dòng)植物新品種、新性狀的培育都提供了全新的探索方向。
理論基礎(chǔ)亟須重大變革 為醫(yī)療實(shí)踐創(chuàng)造更多價(jià)值機(jī)會(huì)
記者:目前在大數(shù)據(jù)醫(yī)療應(yīng)用方面,我們還存在哪些難題?
陳潤(rùn)生:面臨的難題很多,而且問(wèn)題比較復(fù)雜。大數(shù)據(jù)的特點(diǎn)是數(shù)據(jù)量大,現(xiàn)在獲取的組學(xué)數(shù)據(jù)只有一部分得到了較充分的分析,需要建立新方法對(duì)海量大數(shù)據(jù)的信息進(jìn)行解讀。
一方面,我國(guó)現(xiàn)有醫(yī)學(xué)提供大數(shù)據(jù)的樣本量小,比如腫瘤的采樣極少上萬(wàn)。有效事件的頻率也很低,打個(gè)比方,與某一疾病相關(guān)的基因可能有很多個(gè),具體到某一個(gè)基因的變化可能頻率很低。這些動(dòng)態(tài)低頻事件是大數(shù)據(jù)研究中的極大障礙。
另一方面,大數(shù)據(jù)的研究缺乏背景知識(shí)。由于缺少基本知識(shí)作為依托,使得大數(shù)據(jù)分析手段的構(gòu)建也不夠準(zhǔn)確和客觀。大數(shù)據(jù)的處理不僅是數(shù)學(xué)問(wèn)題、信息科學(xué)問(wèn)題,也包含物理學(xué)的問(wèn)題,要求多領(lǐng)域的科學(xué)家共同參與。
除此之外,傳統(tǒng)的系統(tǒng)生物學(xué)相互作用網(wǎng)絡(luò)元件是蛋白質(zhì),非編碼領(lǐng)域研究發(fā)展所產(chǎn)生的大數(shù)據(jù)將是由蛋白和大量RNA組成的動(dòng)態(tài)、有向且更為復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)。這種復(fù)雜性將成為系統(tǒng)生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)的新屬性。
因此,大數(shù)據(jù)雖然為我們提供了重大創(chuàng)新機(jī)會(huì),同時(shí)也要求我們必須從理論基礎(chǔ)上進(jìn)行重大變革,這樣才有機(jī)會(huì)在大數(shù)據(jù)時(shí)代做出全新的成果,為醫(yī)療實(shí)踐和工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)創(chuàng)造更多價(jià)值和機(jī)會(huì)。
用精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)推動(dòng)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新 實(shí)現(xiàn)診斷治療向健康保障轉(zhuǎn)變
記者:你認(rèn)為大數(shù)據(jù)醫(yī)療的未來(lái)方向在哪里?我們應(yīng)該如何去創(chuàng)新?
陳潤(rùn)生:在不遠(yuǎn)的將來(lái),整個(gè)醫(yī)療體系會(huì)發(fā)生翻天覆地的革命,現(xiàn)有的醫(yī)療體系狀況將發(fā)生改變——即把醫(yī)療體系前移,從診治變成評(píng)估,變成干預(yù)。
過(guò)去大家認(rèn)為,醫(yī)療就是進(jìn)醫(yī)院看病。將來(lái),人們會(huì)把整個(gè)醫(yī)療體系前移,建立一套新的診療體系,這套診療體系不是用來(lái)看病的,是對(duì)人類的健康狀態(tài)進(jìn)行評(píng)估,然后通過(guò)評(píng)估結(jié)果進(jìn)行病前干預(yù)。這就是未來(lái)醫(yī)學(xué)發(fā)展的方向——精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。
所謂精準(zhǔn),就是精準(zhǔn)到分子水平,我們能精確地知道疾病、健康、生命活動(dòng)的分子基礎(chǔ),包括基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組學(xué)等一系列組學(xué)。如果把這過(guò)程中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)的把握、獲取、分析、解釋好了,將會(huì)助推我國(guó)中醫(yī)取得更大發(fā)展。
一直以來(lái),我國(guó)傳承數(shù)千年的中藥,因?yàn)閭涫芩幤焚|(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)缺失、專利意識(shí)淡薄、科技研發(fā)滯后等問(wèn)題困擾,使得在國(guó)際中藥市場(chǎng)被“洋中藥”壟斷,國(guó)內(nèi)市場(chǎng)也越來(lái)越受到“洋中藥”的沖擊。
造成這一原因,我認(rèn)為關(guān)鍵問(wèn)題是原始創(chuàng)新力的不足。當(dāng)前,由于藥企自主創(chuàng)新能力有限,無(wú)法解決醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)后繼產(chǎn)品體系,已成為制約我國(guó)醫(yī)藥行業(yè)發(fā)展的主要障礙。
我們應(yīng)該怎么辦呢?以貴州為例,作為我國(guó)苗藥、民族藥的重要產(chǎn)地,可以在大數(shù)據(jù)、大健康產(chǎn)業(yè)相融合創(chuàng)新上做文章。建議貴州省注意數(shù)據(jù)的積累,在數(shù)據(jù)中尋找突破口,為創(chuàng)新藥物的科技研發(fā)提供原動(dòng)力,從而在做強(qiáng)品種、做優(yōu)結(jié)構(gòu)方面,做到人無(wú)我有、人有我優(yōu),形成具有貴州特色的新醫(yī)藥大健康產(chǎn)業(yè)體系。
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